填补Qiagen空白、不用DNA酶消化的植物RNA提取试剂盒
一般公司多糖多酚植物RNA提取试剂盒失败原因和解决方案
很多植物RNA的样品由于含有大量的多糖、多酚、代谢产物、色素等成分,造成RNA提取过程中氧化、褐化、降解、由于植物品种的多样性造成情况更 加复杂。手工的CTAB类的方法提取因为时间太长,太繁琐,手工方法不在讨论之列。一直以来没有一款好的试剂盒包括qiagen、promega等进口试 剂盒也无法满足科研工作者对植物RNA提取的要求。
下面我们来分析一下植物RNA为什么不能提取成功的原因:
市面上zui常见的RNA提取试剂盒无非是两种:*种:TRIzol改良类方法(包括溶液型的和离心柱型的)、第二种:直接裂解过柱子的方法(离心柱)
*种试剂盒失败的原因1:RNA市面上面zui流行的方法就是TRIzol,或者TRIzol改良,或者TRIzol加离心柱一类的改良方法。 TRIzol也就是异硫*酸胍/苯酚/氯仿原理一步法的方法的对象是动物源性的组织细胞,针对普通多糖多酚低的植物性的材料,TRIzol类原理产 品也可以提取。但是多糖、多酚、次级代谢产物丰富的情况下,TRIzol类方法无法防止多糖多酚对于RNA/DNA分相的干扰,要么残留大量DNA,要么 残留大量多糖、多酚或者次级代谢产物,氧化破坏RNA,或者残留这些多糖多酚,色素代谢产物等抑制下游的反转录等反应。限于技术水平的限制,市面上绝大多 数的国产厂家是使用TRIzol的方法进行改良,无论是不是加了离心柱。但是实践证明,改良不能从根本上解决问题。判断是否试剂盒使用这种改良的方法非常 简单:是否裂解液含有苯酚的味道和使用氯仿,如果使用到了氯仿就是TRIzol方法的改良。
第二种试剂盒失败的原因:直接裂解过柱子的方法是目前的方法,但是也是技术含量zui高的方法。这个方法采用裂解液(不含苯酚,氯仿)直接裂 解,RNA/DNA同时过柱子,然后在柱子上面直接分离RNA/DNA,所以,这种方法的优点*在于,避免了使用trizol在多糖多酚下不能成功分离 RNA/DNA的弊端、第二在于,不使用有毒的苯酚氯仿。但是正是因为其技术先进,所以难度很高,国内厂家包括进口公司有两个技术难点一直没有突破。第 一,裂解液的成分必须针对去除多糖多酚进行研发添加去多糖多酚,代谢产物成分。否则会同样碰到多糖多酚干扰提取的问题。第二、和TRIzol原理不同,直 接过柱法DNA/RNA同时加到吸附柱上去。如何去除DNA是*个难点。否则会残留大量DNA。两个技术难点的没有掌握导致了国内公司包括的第二种试剂 盒失败。国外公司因为没有掌握*难点,裂解液里面没有去除多糖多酚成分,所以包括Qiagen的RNeasy plant mini kit盒子也常常不能成功提取较复杂植物RNA样品如黑加仑、冬青等植物样品。
上海恒远的研发人员经过3年的不断研发改良,针对多糖多酚植物的特点,和这两种试剂盒失败的原因,开发出了世界水平的RN09 EASYspin植物RNA快速提取试剂盒,*:采用直接过柱子方法,*抛弃了TRIzol苯酚,氯仿原理方法,使用无毒原料,并且添加了有自主知识 产权的去除多糖多酚成分解决了多糖多酚和代谢产物对于RNA的破坏和干扰分离。第二:突破了直接过柱子的方法DNA去除的技术难点,解决了DNA残留过多 问题。经过实践过程中,几十种国内外试剂盒包括Qiagen的RNeasy mini kit 提取失败的例子,包括棉花苹果等试剂盒不易提取的样品,使用上海恒远的EASYspin植物RNA提取试剂盒,20分钟可以轻松提取,不需要液氮, 无苯酚氯仿。高质量的RNA可以成功完成下游反应试验。第三:实践过程中我们发现,部分复杂植物或者DNA含量特别丰富的植物样品使用Qiagen的 RNeasy plant mini kit 会有明显残留。尝试北京艾德莱的RN09 EASYspin植物RNA快速提取试剂盒也一样有明显残留。对此问题Qiagen并没有提供的解决方案。Qiagen只是建议使用传统的DNA酶消 化的方法来解决,但是*DNA酶消化的方法非常繁琐,费时间,消化后要回收,效果不好,还常常降解RNA,让人望而生畏,而且成本高昂,单单 Qiagen的配套DNA酶柱上消化试剂盒就要1100元/50次,如果还要使用RNA清洁纯化回收DNA酶消化后的盒子就更昂贵了。近年来北京艾德莱又 投入大量研发人力物力,终于*并且推出RN38 EASYspin plus 植物RNA提取试剂盒解决了DNA残留问题,该试剂盒使用基因组DNA清除柱子,配合*研发的溶液,不需要DNA酶消化,操作简单仅需增加10秒钟清除 基因组DNA残留的步骤,不用苯酚,氯仿,30分钟完成全部试验过程。我们测试的几种植物样品中均已经获得成功,使用Qiagen的RNeasy plant mini kit 和我们RN09 EASYspin 植物RNA提取试剂盒有残留DNA的样品种类使用这款RN38 EASYspin plus 植物RNA提取试剂盒后,均无DNA残留。
部分成功样品:
棉花、海棠、黑加仑、烟草、拟南芥、虎杖、大豆、草莓、冬青、月季、蔷薇、沙棘、冬枣、芦荟、仙人掌、报春花、水稻、玉米、唐菖蒲、樱桃、白玉 兰、毛白杨、樱花、葡萄、百合花、紫菜、绿藻、香蕉、水仙花、青花菜、地被菊、苹果、梅花、番茄、石斛、毛桃、苎麻等等,其中qiagen无法提取的黑加 仑、promega无法提取的海棠等、均可用该产品成功提取。
推荐:上海恒远的RN09 EASYspin 植物RNA提取试剂盒为*产品,世界水平,不使用苯酚,氯仿有毒性物质,采用离心柱型操作,添加有自主创新的多糖多酚去除成分,是多糖多酚样品的特 效产品,不需要液氮,20分钟内得到高质量RNA。成功提取Promega无法提取的海棠叶片、Qiagen无法提取的黑加仑等样品。是国产试剂赶超世界 较高水平的一个典型例子。同时上海恒远推出的RN38 EASYspin Plus植物RNA提取试剂盒进一步解决了Qiagen的RNeasy plant mini kit 部分植物样品残留大量DNA污染的问题,采用了的方法10秒钟解决残留问题,是上海恒远核酸分离技术遥遥的又一个里程碑,处于世界水平。